腸道菌群與宿主的共生，以及對(duì)宿主的生長(zhǎng)和發(fā)育等都具有重要作用。當(dāng)缺乏腸道微生物時(shí)，哺乳動(dòng)物微絨毛發(fā)育不良，結(jié)腸上皮細(xì)胞包含的細(xì)胞數(shù)明顯減少，表明哺乳動(dòng)物的腸道正常發(fā)育需要有腸道菌群的共生，腸道菌群參與了宿主的進(jìn)化過(guò)程，促進(jìn)了腸道上皮細(xì)胞的生成和發(fā)育。人體腸道菌群的定植種類(lèi)對(duì)其健康發(fā)展具有至關(guān)重要的影響。

嬰兒從母體中分娩出時(shí)就從母體獲得一些菌鐘，并且不同的生產(chǎn)方式如順產(chǎn)和剖宮產(chǎn)嬰兒腸道菌群存在顯著差異，順產(chǎn)的嬰兒主要定植菌為以乳桿菌為主的乳酸菌和普氏菌。

一般情況下，隨著年齡的增長(zhǎng)，腸道優(yōu)勢(shì)菌群間的比例會(huì)改變。到了老年，人體內(nèi)的雙歧桿菌等有益菌的數(shù)量顯著下降，而產(chǎn)生硫化氫等有害物質(zhì)的小梭菌等有害菌增加，這些腸道微生態(tài)的變化有可能加速衰老的過(guò)程。因此，腸道菌群動(dòng)態(tài)地參與了人的生長(zhǎng)、發(fā)育和衰老的整個(gè)生命過(guò)程。